学校坚持以学科建设为龙头。学校主干学科临床医学进入ESI全球排名前1%。现有3个硕士学位授权一级学科,5个硕士专业学位授权点;临床医学、基础医学和护理学3个省级重点一级学科;以临床医学为主干一级学科,基础医学、药学和护理学等三个支撑一级学科整合申报的“现代医药技术学科群”为湖北省“十三五”优势特色学科群;外科学、内科学、人体解剖与组织胚胎学、麻醉学等10个“楚天学者计划”设岗学科。建有1个院士专家工作站、1个国家中医药三级实验室、17个省部级科研平台,4个省级校企共建研发中心、6个市级校企共建研发中心,南水北调水源区生物医药研发检测共享平台进入湖北省科学仪器设备协作共用网,实现网上预约测试,可提供高效便捷的技术服务。拥有国家中西部地区结合部最大的医学图书馆,馆藏图书124.79万册,购买有《中国生物医学文献数据库》、《中国知网数据库》、《维普智立方》、《万方医学网》、《SCI(Web ofScience)》、ProQuest平台下的《PHMC电子期刊全文数据库》等22余个中外文数据库。校园网覆盖全校,是鄂西北唯一的中国教育科研网城市节点。《湖北医药学院学报》被美国《化学文摘》收录,是国家科技部统计源期刊,面向国内外公开发行。近年来,我校共承担各级各类纵向项目1286项,其中国家自然科学基金83项,国家社会科学基金2项。2010年以来,获得省科技进步奖52项,第七届全国高等学校科学研究优秀成果奖(人文社会科学)1项,湖北省高校人文社科优秀成果奖2项;十堰市科技进步奖113项,十堰市社会科学优秀成果奖59项;获得授权专利452项,其中发明专利4项,计算机软件著作权1项、出版学术著作76部。发表SCI等三大检索论文1377篇,其中刘忠武教授、李健教授在《Nature》、《New England Journal of Medicine》杂志上发表的论文引起国内外业内人士的高度关注。由我校课题组主持完成的调研报告《湖北省健康扶贫调查报告》获得湖北省人民政府主要领导批示采纳;由学校作为主要参与单位完成的调研报告《关于建设左右江革命老区农村电商助推乡村振兴示范区的建议》获得贵州省委省政府主要领导批示采纳。学校高度重视政产学研合作,先后与丹江口市、房县等政府、骨干生物医药企业签订产学研合作协议,主动服务区域经济发展和产业转型升级。承担产学研合作项目56项,签订产学研合作框架协议31项,选送36人次参与省“三区”人才计划,支撑地方生物医药企业科技创新;建立湖北技术交易所湖北医药学院分站。